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: 2016年2月，习近平总书记批示国家科技部和国家卫计委，成立中国精准医疗战略专家委员会。随后，提出中国精准医疗计划，并将其列入国家“十三五”科技发展重大专项，上升为国家战略。为响应国家精准医疗计划，诺禾致源引进国际成熟的管理和服务体系，同时拥有先进的医学检验设备，汇集大批技术与管理人才，具备标准的生产流程、完善的质控体系及高素质的检验人员，目前已与国内外高水平医疗机构和临床专家开展广泛合作。诺禾致源以深度基因测序和大数据分析为核心技术，持续开发并注册基于数字PCR平台，NGS平台系列的肿瘤分子病理诊断仪器及试剂，为医疗机构提供稳定可靠的产品。同时，诺禾致源通过对肿瘤患者进行基因检测，整合各癌种驱动基因突变信息，构建符合中国人群的肿瘤基因突变数据库并基于该数据库进行系列研究，主要内容包括肺癌基因检测研究、结直肠癌基因检测研究、乳腺癌基因检测研究等方向。

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: 2016年2月，习近平总书记批示国家科技部和国家卫计委，成立中国精准医疗战略专家委员会。随后，提出中国精准医疗计划，并将其列入国家“十三五”科技发展重大专项，上升为国家战略。为响应国家精准医疗计划，诺禾致源推出“万人基因组计划”，通过对中国人进行大规模基因组测序和分析，初步构建起包含5万中国典型人群的基因组数据库，基于该数据库进行系列研究，主要内容包括新生儿遗传病研究、遗传性肿瘤易感基因研究、心源性猝死基因研究、药物敏感性基因研究、“三高”易感基因研究、老年人常见疾病易感基因研究等方向。将基因组学信息与医学知识结合，不但有助于保障国人健康，促进医学发展，还将推动基因组学产业的繁荣发展。本项目也诚邀社会各界人士共同参与，建设符合中国人群特点的基因组数据库。

建库测序: 二代建库测序服务; 三代建库测序服务

转录调控测序: 全长转录组（三代）; 真核有参转录组测序; 真核无参转录组测序; 原核转录组测序; 宏转录组测序; 医学转录组测序; 单细胞转录组测序; 比较转录组与泛转录组测序; lncRNA测序; circRNA测序; small RNA测序; 10x单细胞转录组

表观组测序: 全基因组甲基化测序; ChIP-seq; RIP-seq

分子基因编辑: 多重PCR_SNP检测; 质谱SNP检测; KASP基因分型; Target-seq; 植物基因编辑; 细胞基因组编辑; 基因工程鼠模型; Hi-Tom; CRISPR Screen; PCR产物脱靶检测; WGS全基因组脱靶检测

市场与支持: 科服月刊; 测序指南; 蛋白代谢指南; 基因课堂; 市场活动与进展; 文章成果

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: 北京诺禾致源科技股份有限公司于2011年3月在北京中关村生命科学园注册成立，专注于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究和人类健康领域的应用，致力于成为全球领先的基因组学产品和服务提供者。企业总部位于北京，在天津、南京、美国和新加坡设有实验室或实验基地，并在香港、美国和英国设有子公司，办公面积逾36'000m²。

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非编码测序研究 miRNA 调控海参免疫的机制

2016-01-08 编辑：诺禾致源

海参是棘皮动物门、海参纲动物的统称，
海洋底栖生物能在高浓度病原体微生物环境中生存有其特有的免疫机制。
其免疫应答由参与免疫反应的效应细胞-体腔细胞和多种体液免疫因子共同介导。
《本草纲目拾遗》中记载其味甘咸，补肾，益精髓，其性温补，足敌人参。
海参不仅药用价值广，其商业价值也高居不下，并且为当今饕餮大餐中不可或缺的一员。

研究简介

大连海洋大学张峰教授团队通过 Small RNA 测序研究miRNA调控海参免疫的机制，
分析了 miRNA 家族中的 miR-137 的结构及进化，
研究成果发表于2015年12月的 Scientific Reports（IF：5.578），
其中 Small RNA 测序工作由诺禾致源完成。

研究方法

取材

实验组取 10 mg LPS 溶于 5 ml 无菌海水中，注射 0.5 ml LPS 液体；而对照组注射 0.5 ml 无菌海水
取 LPS 处理后 6h（A06）、12h（A12）的体腔细胞及对照组（A00）海参的体腔细胞检测

建库

构建 cRNA 文库（140-160 bp）

测序

Illumina HiSeq 2500 SE50

研究内容与结果

1 miRNA 长度筛选

分析 miRNA 的长度分布，主要分布在 21-23 nt。其中 A06 中的有多个 miRNA 分布在 27-29nt，经分析多是 scnRNA。

2 新miRNA预测

通过分析三个海参样品中的 miRNA，发现有38个 miRNA，并通过软件预测出3个新的 miRNA，其中 spu-mir-2004、spu-mir-2005 仅在棘皮动物中存在。

3 miRNA的家族分析

3.1 对其中的 miRNA-137 结构进行研究，发现它的第一个碱基 2-8nt 确实与脊椎动物中的 miRNA-137 高度保守，由于 miRNA 是依靠2-8位碱基进行靶基因识别，因此此高度保守序列导致其 spu-miR-137 功能与脊椎动物中的 miR-137功能一致。

3.2 选取脊椎动物和无脊椎动物的 miR-137 序列进行进化分析，发现棘皮动物的 miR-137 和节足动物来自同一个祖先。

4 miRNA 表达水平分析

通过 miRNA 表达水平分析进行聚类，绘制热图。发现在三个海参样品中主要有三种表达模式：（1）在 A06 和 A12 中都高表达；（2）仅在 A06 中高表达；（3）在 A00 和 A12 中高表达。

5 qPCR检测C3表达量

研究认为，多数差异表达的 miRNA 的靶基因功能与免疫应答相关，其中以补体 C3 的功能最为相关。研究人员对LPS处理后不同时间的样本中的补体 C3 进行 qPCR，发现在 LPS 处理这个免疫过程中，miRNA 起着主要的调控作用。

图1 三个样本中的sRNA长度分布

图2 miRNA的结构预测

图3 miR-137结构分析

图4 miR-137的进化分析

图5 miR-137的进化分析

图6 miR-137的进化分析

结论与讨论

本研究在着重于 miRNA 靶基因预测，从结构入手，分析样本中 miRNA 的二级结构及其进化。
研究证实了 miR-137 是一个在多个物种中普遍存在并参与免疫活动的 microRNA 家族，
对这一家族的序列比对分析有助于揭示免疫进化机制。
另外，比较发现无脊椎动物与脊椎动物的 miR-137 序列大体相同，
但是在对于 miRNA 识别功能极为重要的前十位碱基上有两处不同。
该研究成果对深入揭示棘皮动物免疫机理具有重要的意义。

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