诺禾致源

1 miRNA 长度筛选

分析 miRNA 的长度分布，主要分布在 21-23 nt。其中 A06 中的有多个 miRNA 分布在 27-29nt，经分析多是 scnRNA。

2 新miRNA预测

通过分析三个海参样品中的 miRNA，发现有38个 miRNA，并通过软件预测出3个新的 miRNA，其中 spu-mir-2004、spu-mir-2005 仅在棘皮动物中存在。

3 miRNA的家族分析

3.1 对其中的 miRNA-137 结构进行研究，发现它的第一个碱基 2-8nt 确实与脊椎动物中的 miRNA-137 高度保守，由于 miRNA 是依靠2-8位碱基进行靶基因识别，因此此高度保守序列导致其 spu-miR-137 功能与脊椎动物中的 miR-137功能一致。

3.2 选取脊椎动物和无脊椎动物的 miR-137 序列进行进化分析，发现棘皮动物的 miR-137 和节足动物来自同一个祖先。

4 miRNA 表达水平分析

通过 miRNA 表达水平分析进行聚类，绘制热图。发现在三个海参样品中主要有三种表达模式：（1）在 A06 和 A12 中都高表达；（2）仅在 A06 中高表达；（3）在 A00 和 A12 中高表达。

5 qPCR检测C3表达量

研究认为，多数差异表达的 miRNA 的靶基因功能与免疫应答相关，其中以补体 C3 的功能最为相关。研究人员对LPS处理后不同时间的样本中的补体 C3 进行 qPCR，发现在 LPS 处理 这个免疫过程中，miRNA 起着主要的调控作用。

图1 三个样本中的sRNA长度分布

图2 miRNA的结构预测

图3 miR-137结构分析

图4 miR-137的进化分析

图5 miR-137的进化分析

图6 miR-137的进化分析