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产品介绍常见问题经典案例结果展示


结果展示

与参考基因组比对

严格的比对率、MspI 酶切效率、覆盖深度、甲基化位点分析

展示的比对率是指唯一比对上的 reads 数占总 reads 数的
比例,是测序获得的有效数据。MspI 酶切效率即唯一比对
的 reads 中含酶切位点 reads 所占比例。通过软件比对,
进行甲基化位点分析,获得样本中可靠的甲基化位点信息。

甲基化的分布

反应不同样本的甲基化的水平

不同样本上的甲基化水平分布,反映了不同样本之间甲基化
水平的差异。

差异甲基化(DMR)分析

差异甲基化修饰区域(Differentially Methylated Region,
DMR)指在不同样本之间,甲基化修饰水平具有显著差异的
基因组区域,这些区域在基因表达调控方面发挥重要作用。
利用 DMR 所在的基因组位置与基因组结构注释信息,对其
进行结构注释。通过 DMR 鉴定,并将锚定的基因、锚定的
promoter 区域相关基因绘制维恩图进行展示。

相关基因富集分析

相关基因富集分析

Gene Ontology(GO)是基因功能国际标准分类体系。对相
关基因做 GO 富集分析,可以挖掘 DMR 调控基因相关的生物
学功能、细胞组成、生物学过程。

KEGG 富集分析

在生物体内,不同基因相互协调行使其生物学功能,通过
Pathway 显著性富集能确定相关基因参与的最主要生化代
谢途径和信号转导途径。